Outre les substances nocives, les eaux usées contiennent d’innombrables bactéries et virus. Par conséquent, la désinfection au chlore est largement utilisée pour tuer les bactéries et les virus présents dans l’eau pendant la phase d’effluent des usines de traitement de l’eau du robinet et des eaux usées.
Dans le traitement de l’eau de refroidissement industrielle en circulation, le chlore est également utilisé pour stériliser et éliminer les algues. Dans le processus de circulation de l'eau de refroidissement, en raison de l'évaporation d'une partie de l'eau, les nutriments contenus dans l'eau sont concentrés et les bactéries et autres micro-organismes se multiplient en grande quantité et forment facilement de la saleté visqueuse. Trop de saleté visqueuse entraînera le blocage des tuyaux et la corrosion.
La chloration consiste généralement à injecter du chlore dans l'eau pour tuer les bactéries et autres micro-organismes, généralement présents dans le chlore en bouteille.
Afin de maintenir l'effet bactéricide, le chlore résiduel doit toujours être maintenu à {{0}},5 ~ 1 mg/L dans l'eau rejetée et à la fin du réseau d'alimentation en eau à 0. 0,05 ~ 0,1 mg/L.